装置一覧
次世代シーケンサー(ロングリード) Oxford Nanopore GridION
ナノポアテクノロジーによる超長鎖 DNA/RNA リアルタイム解析装置。バクテリア / 非モデル生物の de novo ゲノムアセンブリや、転写産物の全長解析に使用しています。
次世代シーケンサー(ショートリード) Illumina MiSeq
Illumina社の短鎖 DNA 並列型シークエンス解析装置。バクテリア / 非モデル生物の de novo ゲノムアセンブリや、転写産物の解析に使用しています。
カセット型全自動電気泳動システム Agilent TapeStation 4150
1 ランあたり最大 16 サンプル処理可能な、DNA および RNA サンプルの品質管理用の全自動電気泳動システムです。NGSライブラリーのQCに使用します。
リアルタイムPCR装置 ThermoFisher QuantStudio 1
ごくごく一般的なリアルタイムPCR装置。Fastモードだと40分でサイクルが終わります。が、ラボでそんなに急ぐことは少ないかな。
トランスイルミネーター Atto WSE-5300
電気泳動後のゲルを観察するための装置。UV照射でエチジウムブロマイドやSYBR Greenで染色した核酸を可視化します。SDS-PAGEゲルにも対応しています(ただ明視野で撮るだけ)。
オールインワン蛍光顕微鏡 Keyence BZ-810
高感度な蛍光観察が可能な研究用倒立顕微鏡。GFP・RFPなど各種蛍光タンパク質の発現観察や、蛍光 in situ ハイブリダイゼーションによる細胞のmRNA転写産物解析等に使用しています。
1粒子マニュアルピッキング装置 Nepa Gene MPP-200B
倒立顕微鏡下で粒子をピックする装置。8連チューブに分注も可能です。慣れれば1時間あたり結構な数を捕れるとか。
フローサイトメーター(アナライザー) Beckman Coulter CytoFLEX
488励起の1レーザーを搭載したセルアナライザー。簡単なFSC/SSCのパラメーターを取得したり、GFP陽性率などの計測に使用しています。
微小液滴生成用圧力ポンプ On-Chip Biotechnologies Droplet Generator
微小液滴の生成等に使用する圧力ポンプ。3種類の異なる圧力を同時に印加できます。倒立顕微鏡と組み合わせて使用しています。
マルチプレートリーダー ThermoFisher Multiskan GO
96 wellプレートに対応したマルチプレートリーダー。時系列データも取得可能です。蛍光には対応していません。
ビーズクラッシャー TAITEC μT-12
その名の通りビーズ破砕機。チューブ内に組織とビーズを入れた状態で(高速に)フリフリしてくれます。酵素処理で溶かすより均一に細菌からDNAを抽出できると思っています。
※ 掲載装置は代表例です。その他の装置については研究室までお問い合わせください。